由北京奶牛中心承担完成的“奶牛良种自主繁育体系建立及关键技术研究”课题，充分发挥首都奶牛种源与技术优势，依托以基因组选择为核心的现代奶牛育种技术，在构建北京地区奶牛良种自主繁育体系，组建先进生产水平的万头规模高产奶牛良种群体等方面取得显著成效。

该课题建立了全国首个奶牛基因组选择参考群体及技术平台，主要性状遗传评估准确性60%以上，填补了我国荷斯坦牛育种早期选择关键技术空白，获软件著作权2项；利用信息技术手段，以生产性能测定、体型鉴定等技术为核心，建成我国规模达11万头的奶牛育种联合体，DHI参测规模达4.83万头，年体型鉴定超过1万头次，通过群体改良技术的综合示范，示范牛场种子母牛单产水平达到12505千克；收集了北京地区历史记录中超过9万头奶牛的繁殖性能数据，并利用上述数据对繁殖性状的遗传参数进行了估计，是我国开展奶牛育种工作的重要基础。

课题将基因组选择等分子育种与传统育种技术进行了有机整合，建立了种公牛自主培育体系技术框架规程，自主培育后备公牛138头，可获验证公牛60头，在2014-2015年农业部良补项目GCPI成绩评估中有5头进入前十名，对推动荷斯坦种公牛自主培育工作起到重要的示范作用，为北京地区奶牛良种自主繁育工作奠定了扎实基础。